Отделение является структурным подразделением ГПНТБ СО РАН и одновременно - Центральной библиотекой новосибирского Академгородка. Обслуживание читателей ведется с 1966 года. До 1976 года библиотека работала в здании ВЦ (пр. Лаврентьева, 6), а затем - в едином читальном зале по ул. Ильича, 21.

До сентября 2004 года в здании ВЦ располагались читальный зал патентной документации и основное книгохранение Отделения, а в здании по ул.Ильича - научный читальный зал, читальный зал справочно-информационной работы, весь справочный аппарат библиотеки, сектор формирования фондов и МБА.

В апреле 2001 г. Президиум СО РАН издал распоряжение N 15000-226 «О реорганизации Приборно-метрологического центра СО РАН путем присоединения его к Институту ядерной физики с целью более эффективного использования производственных площадей». Пункт второй этого распоряжения гласит: «...Площади, освобождаемые Приборно - метрологическим центром СО РАН, передать на условиях договора безвозмездного пользования Государственной публичной научно-технической библиотеке...».

После двухлетнего капитального ремонта переданных Отделению площадей и переезда в новое здание в сентябре 2004 года произошло объединение всех фондов и подразделений библиотеки под одной крышей.

Отделение располагает фондом около 1,5 млн. печ. ед., среди которых около 300 тыс. книг и журналов и более 1 млн. печ. ед. патентной документации.

Отделение является ведущим структурным подразделением в области централизованного МБА, обслуживая 28 абонентов Академгородка. Отделение располагает набором баз данных, имеет доступ в Интернет, ведет информационное обслуживание в Академгородке, выполняет функции Информационного центра для библиотек Академгородка.