Доктор технических наук, профессор, заслуженный деятель науки РФ, действительный член Академии инженерных наук им. А.М.Прохорова. Специалист в области оптической обработки информации, Фурье-оптики, технического зрения, лазерной метрологии.

С 1987 г. Ю.В.Чугуй – начальник СКБ научного приборостроения СО АН СССР, с 1991 г. (после преобразования СКБ НП) директор Конструкторско-технологического института научного приборостроения СО РАН (КТИ НП СО РАН).

Лауреат премии Правительства РФ в области науки и техники (2014).