4 марта 1960 г. была организована Читинская комплексная лаборатория Сибирского отделения АН СССР, с создания которой началась академическая наука в Забайкалье.

В состав лаборатории вошли 3 отдела: геологии и полезных ископаемых, экономики и географии, лесного хозяйства. Постановлением Президиума АН СССР от 31 марта 1961 г. на базе Комплексной лаборатории СО АН СССР был организован Забайкальский комплексный НИИ СО АН СССР (ЗабКНИИ СО АН СССР), основной задачей которого было изучение природных и экономических ресурсов Забайкалья.

Однако в системе Сибирского отделения институт просуществовал недолго. В результате реорганизации Академии наук СССР в 1963 г. институт передали в состав Госгеолкома СССР. В течение некоторого времени академическая наука в Чите была представлена подразделениями институтов Сибирского отделения.

Вопрос о целесообразности создания академического института в Чите поднимался не раз, но лишь в июне 1981 г. Совет министров РСФСР принял решение об организации Читинского института природных ресурсов (ЧИПР) СО АН СССР на базе ряда работавших в Чите лабораторий институтов Сибирского отделения.